A veces por especificaciones del programa es necesario el uso de diferentes bases de datos en el mismo programa. PHP nos proporciona la instrucción mysql_select_db() que nos permite escoger la base de datos que usaremos para ejecutar los SQLs.
Ejemplo:
<?php
$conexio = mysql_connect("localhost","usuario","pwd");
$sql="SELECT * FROM usuarios_mailing";
//Seleccionamos trabajar con la BD mailing
mysql_select_db("mailing");
$result=mysql_query($sql);
$row= mysql_fetch_array($result);
$ultim_id=$row["user_id"];
$sql="SELECT * FROM usuarios WHERE id>".$ultim_id." ORDER BY id LIMIT 0,5";
//Seleccionamos trabajar con la BD facturacion
mysql_select_db("facturacion");
$result=mysql_query($sql);
....
....
....
?>